Mediante un convenio de colaboración científica entre la Comunidad Autónoma y el Ministerio de Cultura vigente desde 2009, se realiza un diagnóstico del estado de conservación de las cuevas con arte rupestre de Cantabria.
Este proyecto contempla la evaluación del biodeteriro en las cuevas de El Castillo y Las Monedas mediante el empleo de una combinación de técnicas de microbiología tradicional y microbiología molecular para identificar las especies de microorganismos que las habitan, sus requerimientos metabólicos y su influencia sobre el arte parietal.